Z公司是一家研制數(shù)碼機械零配件的公司，研發(fā)實力較強，擁有數(shù)十項發(fā)明專利、實用新型專利，產(chǎn)品在行業(yè)領(lǐng)域內(nèi)具有較強的創(chuàng)新性，技術(shù)處于行業(yè)領(lǐng)先地位。Z公司于2018年通過了高新技術(shù)企業(yè)資格重新認定，繼續(xù)享受15%的企業(yè)所得稅優(yōu)惠稅率。

稅務(wù)人員在審核企業(yè)報送的2018年度企業(yè)所得稅匯算清繳申報資料時，發(fā)現(xiàn)Z公司填報的研發(fā)費用加計扣除金額，遠大于其財務(wù)報表中管理費用的金額，且與高新技術(shù)企業(yè)資格認定標(biāo)準中的研發(fā)費用金額差異較大。

稅務(wù)人員核查發(fā)現(xiàn)，Z公司的研發(fā)費用輔助賬只有各費用的總和，沒有明細記錄，且Z公司加計扣除申報的研發(fā)項目眾多，而當(dāng)年申報高新技術(shù)企業(yè)時提交的研發(fā)項目數(shù)量較少。稅務(wù)機關(guān)對其研發(fā)費用歸集的真實性產(chǎn)生疑問，要求Z公司提供研發(fā)費用輔助賬明細，并說明研發(fā)費用的歸集方法。

針對疑問，Z公司財務(wù)人員解釋道，公司在研發(fā)項目管理上采取兩級研發(fā)管理制度，即以綜合方向研究為標(biāo)準的一級研發(fā)項目（一級項目）和以精細子類研究為標(biāo)準的二級研發(fā)項目（二級子項目），二級子項目在設(shè)置上均包含在一級研發(fā)項目中。公司在2018年申報高新技術(shù)企業(yè)資格時，考慮到二級子項目太多、填報工作量巨大，故選擇按照一級研發(fā)項目進行申報；但是在申報研發(fā)費用加計扣除時，公司則按照二級子項目進行申報。

不管是高新技術(shù)企業(yè)資格認定標(biāo)準中的研發(fā)費用，還是加計扣除的研發(fā)費用，都應(yīng)以研發(fā)項目為歸集基點。根據(jù)《高新技術(shù)企業(yè)認定管理工作指引》（國科發(fā)火〔2016〕195號）和《關(guān)于完善研究開發(fā)費用稅前加計扣除政策的通知》（財稅〔2015〕119號）等文件的規(guī)定，Z公司在日常財務(wù)管理中的主要問題還有：未按規(guī)定對研發(fā)費用進行真實歸集；在高新技術(shù)企業(yè)資格重新認定和研發(fā)費用加計扣除申報中，所涉研發(fā)項目差異較大；沒有設(shè)立單獨的研發(fā)費用輔助賬等。

尤其值得一提的是，在研發(fā)項目的費用歸集上，Z公司財務(wù)人員根據(jù)各研發(fā)項目成果取得的收入占比，將符合條件的研發(fā)費用直接分攤，從而整理出高新技術(shù)企業(yè)認定申請時所需要的研發(fā)費用輔助賬。為減輕工作負擔(dān)，財務(wù)人員直接按填報的高新技術(shù)企業(yè)研發(fā)費用的60%，填報了2018年度研發(fā)費用加計扣除的金額。

因此，稅務(wù)機關(guān)初步判定Z公司的研發(fā)費用歸集方法存疑，要求Z公司書面解釋研發(fā)項目存在差異的原因，并規(guī)范研發(fā)費用的核算制度，完善研發(fā)費用輔助賬。如后續(xù)審查依然存疑的，則考慮向高新技術(shù)企業(yè)認定機構(gòu)提請對其高新技術(shù)企業(yè)資格進行復(fù)核。

目前，研發(fā)費用歸集有三個口徑，分別是會計核算口徑、高新技術(shù)企業(yè)認定口徑以及加計扣除稅收規(guī)定口徑。在日常工作中，建議企業(yè)規(guī)范和加強研發(fā)費用的日常管理，合規(guī)享受稅收優(yōu)惠。

一方面，規(guī)范研發(fā)項目的管理，注意研發(fā)費用加計扣除申報資料與高新技術(shù)企業(yè)申報資料的一致性。如果兩者的研發(fā)項目在數(shù)量、內(nèi)容上差異過大，且缺少合理的解釋，稅務(wù)機關(guān)可能會對企業(yè)申報資料的真實性產(chǎn)生懷疑。實務(wù)中，除了常規(guī)的單層級研發(fā)項目管理模式外，還可從適合日常經(jīng)營和納稅申報的角度出發(fā)，選擇不同的研發(fā)項目管理模式。

另一方面，實現(xiàn)研發(fā)費用的核算管理日常化。企業(yè)應(yīng)制定一套完整的研發(fā)費用核算體系，完善研發(fā)費用輔助賬，將研發(fā)費用的核算管理日?；?。企業(yè)研發(fā)部門應(yīng)將項目產(chǎn)生的費用明細，包括項目名稱、項目人員、費用發(fā)生日期等信息及時反饋到財務(wù)部門，財務(wù)部門應(yīng)及時統(tǒng)計研發(fā)費用，確定好研發(fā)費用分攤方法，編制好相應(yīng)的研發(fā)費用輔助賬，為研發(fā)費用加計扣除和高新技術(shù)企業(yè)資格認定申報打好基礎(chǔ)。